基因表达的不同阶段，例如 mRNA 加工、监视、输出、合成，是与转录延伸相关联的(1,2)。在这些不同阶段的整合中，RNA 聚合酶 II 大亚基的羧基末端 (CTD) 发挥重要作用 (1,2)。IWS1 可与 Spt6 相互作用，而 Spt6 是 CTD 结合转录延伸因子和 H3 分子伴侣 (1,2)。IWS1 还可募集另一种 CTD 结合蛋白，即 HYPB/Setd2 组蛋白甲基转移酶 到 RNA 聚合酶 II 复合体，帮助延伸过程中相关联的H3K36 三甲化基 (2)。因此，IWS1 在一个大复合体中与 Spt6 和 HYPB/Setd2 相联接，调节 mRNA 合成、以及转录水平的组蛋白甲基化 (2)。